各位老师、同学,实验室与北京百迈克公司协商,今年的培训从2014年元月2日下午2:30 开始,在实验室一楼1202多媒体教室进行。培训时间一周,周末不休息。请参加培训的老师和学生按时参加。具体培训内容如下:
1. 测序原始reads质控、过滤分析和mapping常用方法和软件介绍,病原菌和寄主混合样品测序后数据分离方法,上机演示及实践
2. 基因组de novo 测序拼接和组装质量评估常用方法和软件介绍,上机演示及实践
3. 重测序数据分析(variants鉴定)常用方法和软件介绍,上机演示及实践
4. 转录组组装(有参考基因组和无参考基因组下)常用方法和软件介绍,上机演示及实践
5. RNA-seq(mRNA)差异表达基因分析的常用方法和软件介绍(有生物学重复和无生物学重复下),上机演示及实践
6. 基因功能注释和显著性富集分析(GO和KEGG)常用方法和软件介绍,上机演示及实践
7. 小RNA数据分析(sRNA分析,已知miRNA鉴定,miRNA及其靶基因预测)常用方法和软件介绍,上机演示及实践
8. 生物信息学常用统计方法的用途(如方差分析,T-test, Fisher Exact, z-score和z-test等)
9. 降解组测序分析及miRNA靶基因验证
10. chip-seq测序分析及peak富集分析流程
旱区作物逆境生物学国家重点实验室
2013年12月24日
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